Pri vnútornom použití má zo Šalvie lekárskej mnohé pozitívne účinky na ľudské zdravie najmä vňať a listy. Často sú využívané pri žalúdočných a črevných problémoch, ako aj pri ťažkostiach so žlčníkom či nadúvaním. Popísaný je však aj pozitívny vplyv na krvný beh a nervovú sústavu.
Šalvia lekárska má tiež protizápalové, antivirotické a antibakteriálne účinky.